Detección de bacterias fitopatógenas del suelo: Agrobacterium tumefaciens y Ralstonia solanacearum biovar 2

Abstract

Distintas especies de bacterias fitopatógenas de los géneros Agrobacterium, Erwinia, Pseudomonas, Ralstonia y Xanthomonas pueden sobrevivir en el suelo durante períodos más o menos largos, pero su detección en dicho reservorio presenta importantes problemas. La gran diversidad microbiana del suelo y la heterogénea distribución de las bacterias en el mismo dificultan considerablemente el análisis bacteriológico de estas muestras. Por un lado, el método clásico de aislamiento en medio de cultivo sólido no suele dar buenos resultados, debido a la escasez de medios apropiados y/o a la pérdida de cultivabilidad de las células bacterianas bajo determinadas condiciones ambientales. Otro método utilizado, como el uso de plantas trampa, es difícil de aplicar a grandes extensiones de terreno. Por otro lado, los métodos serológicos y la PCR han contribuido a enriquecer la batería de técnicas disponibles para el análisis de bacterias fitopatógenas en muestras de suelo. Sin embargo, debido a la complejidad microbiológica de este sustrato, junto con la abundancia de inhibidores de la PCR en muchos tipos de suelo, suelen dar lugar a falsos resultados positivos y/o negativos. Todo ello ha dificultado en la práctica la aplicación de estas metodologías a la detección rutinaria y los estudios epidemiológicos en muestras de suelo.

A pesar de estos inconvenientes, en los últimos años se han desarrollado distintas estrategias de detección que han permitido avanzar en el conocimiento de la supervivencia en suelo de distintas bacterias fitopatógenas, como Agrobacterium tumefaciens y Ralstonia solanacearum.